Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cib1Q9Z0F4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms