Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnip1Q9WUU8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms