Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Psma4Q9R1P0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms