Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc3Q9R0B6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms