Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek3Q9R0A5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms