Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphs1Q9QZS7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Nphs1Q9QZS7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nphs1Q9QZS7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nphs1Q9QZS7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nphs1Q9QZS7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nphs1Q9QZS7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Nphs1Q9QZS7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphs1Q9QZS7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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