Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpc1Q9QZF2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gpc1Q9QZF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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