Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms