Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms