Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nphp1Q9QY53 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms