Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms