Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms