Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpsf3Q9QXK7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpsf3Q9QXK7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpsf3Q9QXK7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cpsf3Q9QXK7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cpsf3Q9QXK7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpsf3Q9QXK7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpsf3Q9QXK7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cpsf3Q9QXK7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpsf3Q9QXK7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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