Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc5Q9QX29 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpc5Q9QX29 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms