Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdcQ9QW08 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms