Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mid2Q9QUS6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms