Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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