Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc2lQ9JME7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms