Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ush1cQ9ES64 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms