Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Erg28Q9ERY9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms