Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim54Q9ERP3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim54Q9ERP3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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