Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Slc28a3Q9ERH8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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