Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Clstn2Q9ER65 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms