Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufs3Q9DCT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms