Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Znf580Q9DB38 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Znf580Q9DB38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Znf580Q9DB38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Znf580Q9DB38 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Znf580Q9DB38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Znf580Q9DB38 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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