Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgf29Q9DA08 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sgf29Q9DA08 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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