Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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