Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg7Q9D906 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms