Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tvp23bQ9D8T4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tvp23bQ9D8T4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tvp23bQ9D8T4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tvp23bQ9D8T4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tvp23bQ9D8T4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Tvp23bQ9D8T4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tvp23bQ9D8T4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms