Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9D8L0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms