Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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MsraQ9D6Y7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MsraQ9D6Y7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms