Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ptp4a3Q9D658 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ptp4a3Q9D658 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ptp4a3Q9D658 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ptp4a3Q9D658 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ptp4a3Q9D658 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ptp4a3Q9D658 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms