Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PudpQ9D5U5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PudpQ9D5U5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PudpQ9D5U5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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