Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3404Q9D506 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3404Q9D506 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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