Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy3Q9D394 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms