Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt20Q9D312 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt20Q9D312 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms