Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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