Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl28Q9D1B9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms