Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms