Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zbed3Q9D0L1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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