Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms