Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ChtopQ9CY57 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms