Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl11Q9CXW4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms