Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms