Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sft2d3Q9CSV6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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