Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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