Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ifitm3Q9CQW9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ifitm3Q9CQW9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ifitm3Q9CQW9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ifitm3Q9CQW9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ifitm3Q9CQW9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms