Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PompQ9CQT5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms