Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Chchd5Q9CQP3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms