Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms